Där har du nog förklaringen... Om du har bytt allt vatten rengjort allt grus och alla stenar o växter så har du i princip tagit bort alla goa bakterier i karet... en lösning kan vara att tillsätta bakterieflora som går att köpa på flaska i närmaste akvarieaffär. att rengöra allt samtidigt resulterar i princip i en nystart av akvariet så du kan ta en titt här på zoopet under rubriken nystart.
Jag gjorde själv såna misstag för en 15 år sen vilket resulterade i ledsna fiskar vilket då gjorde mig ledsen och jag la ner allt för att återuppta det för ca ett halvår sen...