Nix, den bör vara igång hela tiden. Om filtreringen är avstängd längre tid än ca en timma börjar de trevliga bakterier som lever i filtermaterialet att dö, vilket dels kan leda till att ditt akvarievatten blir förgiftat när du kör igång filtret igen, och dels (mindre akut farligt) att nitrifikationsbakterierna aldrig får en chans att växa till i filtret.
(Här kommer ett litet gnäll också ;) : Det räcker väl med en tråd?)