Det som är viktigast vid val av filter är inte om det är ett ytter eller innerfilter. Det är
1) filtervolymen. Stort filter innebär att filterbakterierna hinner bryta ned smutsen i filtret, och att det inte täpper igen så snabbt som filter med en liten filtervolym. Rätt dimmensionerad storlek ger rengöring av filter ca 1-2 ggr om året (när genomströmningen är hämmad). Små filter behöver rengöras 1-2 ggr i veckan pga att de blir igentäppta. Detta varierar naturligtvis beroende på vilka fiskar och växter man har i akvariumet. Ytterfilter brukar ha tillräckligt stor filtervolym, innerfilter tenderar ha (för) liten filtervolym.
2) filterkapaciteten. Dvs hur mycket vatten i timman (eller minuten, sedan är det bara att räkna om till l/h) som filtret klarar av att pressa genom filtermaterialet. Brukar räkna på MINST akvariumets dubbla volym i timmen. Dvs ett 100 liters bör prestera åtminstone 200 l i timmen. Helst runt 3-4 ggr volymen, dvs i detta exempel ca 300-400l/h. För att det inte skall bli för strömt i akavariumet (ifall fiskarna inte gillar det), så kan man sätta på ett strilrör på utblåset (dvs ett långt rör med många hål borrade längst efter dess hela längd). Det brukar fördela strömmen så att det inte för strömt för fiskarna.
Så allmänt kan man säga (finns naturligtvis undantag) så är ytterfilter bättre val, mest pga stor filtervolym. Men man kan bygga ett tillräckligt stort innerfilter av en blå filtermatta, starkt pumphuvud och ett PVC-rör. Se artikeln om filter här i Zoopet.com.