Våra filter har två huvuduppgifter: att få bort fasta partiklar som fiskarnas avföring och annat samt att få bort skadliga ämnen, som ammoniak och nitrit, vilka är lösta i vattnet.
Fasta partiklar tas bort med sedimentering eller mekanisk filtrering och av heterotrofa bakterier och svampar som bryter ned smutsen.
Lösta ämnen tas bort med biologisk rening. Här är det nitrosomonas och nitrobakter eller nitrospira, de som normalt kallas "filterbakterier", som sköter det hela.
Ju mera effektiv mekanisk rening man har, desto färre heterotrofa bakterier finns det utrymme för.
Det är bra, eftersom dessa annars stjäl plats för "filterbakterierna" .
Vad som definitivt också stör "filterbakterierna" är en massa smuts, som tar filterplats och skapar anaeroba (syrefattiga) miljöer.
Är filtret tillräckligt stort för den mängd fiskar och foder mängd då blir akvariet i balans och det enda som blir i filtret är lite gråbrun slam.