På sikt konstant höga halter av nitrat, gradvis försämrat allmäntillstånd och immunförsvar, algproblem.
Nitrat sägs inte vara "akut" giftigt om inte koncentrationen av nitrat är högre än 120 mg/liter.
Om flera värden är bara något fel (ammoniak, pH, nitrit, nitrat) men på gränsen så förstärks effekten av de något höga/fel värdena och påverkar fisken hälsa negativt.
Om man har ett akvarium utan eller få växter, med normalt antal fiskar som fodras med rätt mäng foder, gör normala vattenbyten, där nitraten är låg eller ingen ska man testa ammoniumvärdet för det kan vara så att nedbrytningen inte fungerar, (tex för litet filter, igensatt filter där vattnet passerar vid sidan av filtret, klor i kranvattnet.)
Ett ammonium värde på 5,0 mg/l och pH 7,0 ger skador på fisken i längden, ett värde på 1,0 och pH 7,5 har samma påverkan.