Låter väldigt troligt att det är sot dina fiskar har. För det mesta hinner inte det gå så långt att malawisar sväller upp innan de dör. Att du inte ser någon trådig avföring behöver inte betyda att de inte har soten. Beteendet avslöjar tillräckligt tycker jag för att man ska misstänka buksot starkt.
Nitriten du hade är en sannolik orsak, plus att vattnvärdena i övrigt kanske gått kräftgång. Med många stora vattenbyten, nitrit-toppar och fördröjd utveckling av nyttiga bakterier som följd och inte klarar av att bryta ner slaggprodukter effektivt. Det är en högrisk-källa till att framkalla buksot - mycket stressande för fisken. Hur länge har du haft igång karet nu? Hur mycket fisk började du med, hur tidigt och hur många fler kom till fram till idag? Kanske gick du för fort fram med för mycket fisk och hamnade i i en ond cirkel med instabila värden. Hur ser din filterkapacitet ut? Vad får de för mat, är också en bra fråga att ta med i beräkningarna?
Men du sa att vattenvärdena är ok nu. Det är ju en bra förutsättning för bättre tider. Risken är dock som du tror, att medicinering också sabbar de mesta av de nyttiga bakterierna. Sen vet jag inte om medicinen du använt hjälper mot buksot. Jag har för mig att jag läst här på forumet att det krävs andra medel än de som vanligen finns i akvariebutikerna för effektiv behandling - rätta mig någon om jag har fel.
Men eftersom du redan börjat tillföra medicin, Så rekomenderar jag att så fort medicineringsprocessen är över. Att du hjälper den goda bakteriefloran att etablera sig med hjälp av Nitrivec eller något liknande. Slam, grus etc. från ett stabilt, etablerat akvarium är också bra. Båda delarna ännu bättre. Inte bara en gång, utan regelbundet under en period.
Det är ovanligt att alla stryker med, men de som redan visar tydliga tecken riskerar nog att gå bort. Även om du har smittan i karet betyder det dock inte att alla kommer att drabbas. Men om stressorsakerna inte försvinner kan det spinna vidare och drabba alla. Du bör egentligen avliva/avlägsna fisk som ser påtagligt dåliga ut direkt för att inte riskera onödig ökad risk för spridning - även om det tar emot. Det är onödigt att chansa och tro att det stannar av spontant efter en individs insjuknande.
Jag har själv aldrig medicinerat mot buksot, eftersom det ställer till det så med balansen i karet, och kan bli lika värre. Själv skulle jag nog försöka fånga den sjuka fisken/fiskarna och behandla dom separat i ett eget kar och på så vis försöka hålla spridningsrisken stången. Om den möjligheten inte finns skulle jag försöka stå emot känslorna och avliva fisk som visar tendenser på att de verkligen mår dåligt, direkt. Notera tydligt till minnes de tidiga tecken i beteendet du erfarit och agera direkt nästa gång det händer. Att kunna isolera fisken i ett eget kar är ju bäst, för då kan du se hur det utvecklar sig och ställa diagnos - och medicinera.
Dina yngel som går i eget kar tror jag du inte behöver oroa dig för.
Hoppas det går den önskvärda vägen för dig.