Snälla hjälp!! Trådig avföring och klåda

En till fråga bara. Hur sprids det, via vattnet, eller??
Håller nämligen på att flytta över fiskar till mitt nya akvarium och har därför eländet i båda akvarierna. Ska jag behandla i det nya där de ska vara, eller i det gamla för att skona växter och sånt.
Vore enklast att behandla i det gamla mindre akvariet men finns skiten kvar i det nya om jag flyttar tillbaka fiskarna till det gamla för behandling???