Någon nämnde här bottensubstratet. Detta tror jag är det enda stället man kan hålla denitrifieringen något så när under kontroll. Om sandlagret är tillräckligt tjockt bör man få ett anaerobt lager längst ned och sedan ett syrefattigt lager någon stans en bit ned mellan den syrebemängda vattenkolumnen och den anaeroba botten. Så fungerar det oftast i naturen. Tricket blir då att kontrollera den anaeroba delen och dess problem.
Om man tittar på naturen så är nog detta den stora skillnaden mellan ett korallrev och en sjö. På ett rev och kanske en atoll pumpas otroliga mängder vatten genom och upp/ned i ett gigantiskt filter mestadels bestående av korall skelett, tack vare vågor men framför allt tidvattnet. I en sjö eller flod påverkar exempelvis vågor endast ytvattnet och flödena är ofta linjära då tidvatten inte existerar.