Om vattnet är brunt så måste det ju vara något annat fel. Jag skulle ha kokat alla inredning när jag ändå tömde karet och inte stoppat ner samma trärötter och liknande inredning som inte går att koka.. Pumpen går ju tyvärr inte att göra så mycket med men filtret skulle jag försöka byta och så skrubba pumpen med hetvatten..

Jag tänkte på krukan??? Kanske experterna kan vakna upp och svara.. men om det är brunt vatten så måste det ju vara en bakterie/alg blomning av något slag och då fel slag för fiskar helt klart.
Allt borde kokas och börja om från början med nitravec och växtnäring. Men hur mycket fisk har ni stoppat ner i det lilla karet egentligen??? ;)